Bertempat di Gedung Baru Kampus UNISLA, Ketua Umum Yayasan Pembina Perguruan Tinggi Islam "Sunan Giri" Lamongan, Dr. Ir. H. CHASAN BISRI, pada hari Minggu tanggal 2 Agustus 2009, melantik Drs. KH. ACHMAD MUDLOR, SH, sebagai Rektor UNISLA masa bakti 2009-2013.  Drs. KH. ACHMAD MUDLOR, SH terpilih secara aklamasi dalam Rapat Senat tanggal 19 Juli 2009 yang dihadiri oleh 98 % dari seluruh anggota Senat Universitas. Rapat Senat UNISLA ini merupakan rangkaian terakhir dari Rapat Senat Fakultas yang telah memilih Dekan di lingkungan UNISLA.

Dalam Pelantikan Rektor yang dihadiri pengurus yayasan ini, Ketua umum yayasan menjelaskan bahwa mekanisme 4 tahunan yang telah dilaksanakan di UNISLA selama ini adalah perintah PP 60 Tahun 1999 dan Statuta UNISLA dan telah terlaksana dengan penuh demokratis tanpa adanya rekayasa dan intervensi dari pihak yayasan sedikitpun.

Dalam usia yang ke 9 tahun ini, mekanisme pemilihan Dekan dan Rektor telah dilaksanakan sebagaimana peraturan perundangan yang ada selama 2 kali sedangkan ketika universitas ini didirikan Pejabat Dekanat dan Rektorat hanya berdasarkan penunjukkan oleh Yayasan.

Mekanisme ini mungkin yang membedakan UNISLA dengan perguruan tingi lain di Lamongan. Dan mkanisme 4 tahunan ini pulalah yang menjadi bukti bahwa UNISLA adalah milik masyarakat dan umat di Lamongan, bukan milik keluarga maupun organisasi masa maupun organisasi politik.. Universitas milik keluarga biasanya Rektor ditentukan dan ditunjuk oleh Yayasan yang terdiri dari keluarga dan Dekanat harus disetujui oleh keluarga pula, demikian halnya Universitas milik Organisasi maka rektor  ditentukan dan ditunjuk harus disetujui oleh Induk Organisasi tersebut.

Mekanisme 4 tahunan sebagaimana diatur dalam peraturan perundangan ini ini perlu untuk dipertahankan apabila perguruan tinggi ini ingin berfungsi sebagai lembaga pendidikan tinggi ang profesional dan terbukti bahwa jajaran rektorat dan dekanat pada masa bakti 2005-2009 mampu membawa UNISLA juara II KKTM bidang IPA Wilaah C (ditingkat Indoneseia Timur) dan Juara II Nasional (medali Perak) PIMNAS kategori Gagasan tertulis dan Poster. 

Dalam kesempatan ini pula Ketua Yayasan sekaligus melantik H. BAMBANG EKO MULJONO, SH.,SpN,MHum, MMA selaku Pembantu Rektor I , Drs. SUYONO, MAg selaku Pembantu Rektor Ii, Ir. Hj. NURIL BADRIYAH, MM selaku Pembantu Rektor III DAN Drs. H. MALCHAN, MAg selaku Pembantu Rektor IV